首先，兩者概念不同
商標(biāo)注銷：指商標(biāo)局根據(jù)商標(biāo)注冊(cè)人本人、或者他人的申請(qǐng)，將注冊(cè)商標(biāo)注銷或部分注銷的法律程序。
商標(biāo)撤銷：是指國(guó)家商標(biāo)局對(duì)違反商標(biāo)法及有關(guān)規(guī)定的行為作出決定或裁定，使原注冊(cè)商標(biāo)專用權(quán)歸于消滅的程序。依照我國(guó)商標(biāo)法第四十九條的規(guī)定，基于法定的事由，商標(biāo)局可以決定或裁定撤銷注冊(cè)商標(biāo)。
其次，兩者所決定的行為也有所不同
注銷注冊(cè)商標(biāo)有以下三種不同程序
(一)商標(biāo)注冊(cè)人申請(qǐng)注銷其注冊(cè)商標(biāo)的，應(yīng)按照《商標(biāo)法實(shí)施條例》第四十六條的規(guī)定，向商標(biāo)局提出申請(qǐng)，注銷注冊(cè)商標(biāo)可以是整體注銷，也可以注銷部分指定商品或服務(wù)項(xiàng)目。
注銷申請(qǐng)經(jīng)商標(biāo)局核準(zhǔn)后，該注冊(cè)商標(biāo)專用權(quán)或該注冊(cè)商標(biāo)專用權(quán)在部分指定商品上的效力自注銷申請(qǐng)之日起終止。
(二) 根據(jù)《商標(biāo)法實(shí)施條例》第四十七條的規(guī)定，注冊(cè)人已死亡或終止一年以上的且未辦理商標(biāo)移轉(zhuǎn)手續(xù)的，任何人可以向商標(biāo)局申請(qǐng)將該商標(biāo)注銷。向商標(biāo)局申請(qǐng)注銷該商標(biāo)的，應(yīng)當(dāng)提交該商標(biāo)注冊(cè)人死亡或者終止的證據(jù)。
經(jīng)商標(biāo)局核準(zhǔn)注銷的注冊(cè)商標(biāo)，其專用權(quán)自該商標(biāo)注冊(cè)人死亡或終止之日起終止。
(三) 根據(jù)《商標(biāo)法實(shí)施條例》第三十八條的規(guī)定，注冊(cè)商標(biāo)有效期滿后，在法律規(guī)定的寬展期內(nèi)仍未提出續(xù)展申請(qǐng)的，該商標(biāo)予以注銷。
這是商標(biāo)局鑒于注冊(cè)商標(biāo)已經(jīng)失效的事實(shí)做出的注銷行為，不需要任何人的申請(qǐng)，該注冊(cè)商標(biāo)專用權(quán)的效力自有效期滿次日起終止。
商標(biāo)撤銷根據(jù)《商標(biāo)法》第四十九條的規(guī)定，注冊(cè)商標(biāo)使用不當(dāng)?shù)某蜂N的事由包括：
(1)商標(biāo)局依職權(quán)的撤銷：
a、自行改變注冊(cè)商標(biāo);
b、自行改變注冊(cè)商標(biāo)的注冊(cè)人名義、地址或者其他注冊(cè)事項(xiàng);
(2)依申請(qǐng)的撤銷：(任何單位或者個(gè)人可以向商標(biāo)局申請(qǐng)撤銷該注冊(cè)商標(biāo))
c、注冊(cè)商標(biāo)成為其核定使用的商品的通用名稱;
d、連續(xù)三年停止使用注冊(cè)商標(biāo);
商標(biāo)注銷與商標(biāo)撤銷的主要區(qū)別有兩種：一是商標(biāo)注銷后是可以重新申請(qǐng)的，但是商標(biāo)撤銷后就不能再此申請(qǐng)了。二是，一般來(lái)說(shuō)，商標(biāo)注銷是主動(dòng)行為，是商標(biāo)注冊(cè)人主動(dòng)注銷的行為，而商標(biāo)撤銷卻是被動(dòng)行為，是給商標(biāo)局裁定撤銷或者他人申請(qǐng)撤銷的行為。