從計算機軟件著作權登記證書最原始的作用來說，企業(yè)將軟件、各類系統(tǒng)、APP進行軟件著作權登記可以明確軟件作品的完成時間、權力關系，尤其是委托作品、職務作品等進行軟件著作權登記可以很好的明確作品的發(fā)表權、開發(fā)者身份權、使用權和獲得報酬權等權利。
企業(yè)通過軟件著作權登記，可以更好向社會宣傳自己的產品，同時在發(fā)生著作權爭議時可以作為主張權利的有力武器，同時也是提起訴訟請求司法保護的前提。軟件產品登記可以作為企業(yè)自主知識產權的證明材料，可以幫助企業(yè)在我國境內內經營或者銷售其產品，并出版發(fā)行。
根據(jù)財政部、國家稅務總局相關規(guī)定，對經過國家版權局注冊登記，在銷售時一并轉讓著作權、所有權的計算機軟件征收營業(yè)稅，不征收增值稅。
企業(yè)進行軟件著作權登記可以作為企業(yè)融資的工具，在申請科研項目或者專項資金時可以作為證明材料，同時在企業(yè)經營過程中、與客戶交易過程中，可以增強客戶的企業(yè)實力的直觀印象和判斷。
以上是計算機軟件著作權對企業(yè)本身最基本的作用，目前對于企業(yè)來說，進行軟件著作權登記最重要的是可以作為雙軟企業(yè)、高新企業(yè)認證的證明材料，從而獲得稅收減免、資金獎勵等政府的優(yōu)惠政策。
可以說，企業(yè)進行計算機軟件著作權登記主要是奔著這些"增值福利"去的，根據(jù)各地不同的政策，不僅國家對于這類申請有鼓勵政策、優(yōu)惠政策，各地政府還有不同程度額補貼。
因此，計算機軟件著作權登記對于軟件企業(yè)發(fā)展是非常重要的一件事，無論是保護企業(yè)技術，還是作為訴訟證據(jù)，還是作為申請各類資質的材料，都是十分必要的。